শিক্ষা প্রকৌশল অধিদপ্তর বাংলাদেশের স্বাধীনতার পূর্ব থেকেই বিভিন্ন সহযোগী সংস্থা হিসাবে এবং ফ্যাসিলিটিজ ডিপার্টমেন্ট নামে দেশের বিভিন্ন শিক্ষা প্রতিষ্ঠানে ভৌত, অবকাঠামোগত এবং সেবামূলক কার্যক্রম প্রদান করে আসছে। এর নিজস্ব কোন অফিস নেই। উপজেলা মাধ্যমিক শিক্ষা অফিসেই এর সকল কার্যক্রম সম্পাদিত হয়ে থাকে।
পরিকল্পনা ও বাস্তবায়নে: মন্ত্রিপরিষদ বিভাগ, এটুআই, বিসিসি, ডিওআইসিটি ও বেসিস